Международная группа исследователей из Вашингтонского университета, Оксфордского университета и Nvidia представила генеративную ИИ-систему RFdiffusion3. Система позволяет проектировать белки и нуклеиновые кислоты на уровне отдельных атомов. Результаты работы были опубликованы в журнале Science 16 октября.
Проект, ставший открытым 3 декабря 2025 года, использует архитектуру AlphaFold3. RFdiffusion3 способна описывать аминокислоту с помощью 14 атомов, напрямую корректируя их 3D-координаты. Система учитывает заданные условия, включая формирование водородных связей и распределение атомов внутри структуры белка.
В тестах на проектирование активных центров ферментов RFdiffusion3 показала лучшие результаты, чем RFdiffusion2, в 37 из 41 случая. Скорость генерации структур выросла в 10 раз. Эффективность системы подтверждена экспериментально при создании ферментов для деградации фосфорорганических соединений и расщепления пептидов.
Руководителем исследования выступил лауреат Нобелевской премии по химии 2024 года Дэвид Бейкер, известный разработкой системы RosettaFold. RFdiffusion3 продолжает развитие технологий ИИ, переходя от предсказания трехмерных структур существующих белков к созданию новых молекул с заданными функциями.
